組織蛋白酶是在各種動物組織的細胞內發現的一類蛋白酶。此名源自希臘語的“消化”，來源于同一種類組織細胞的也是由組織蛋白酶A．B．C．D．E等多種酶組成。可以根據所作用的代表性底物的種類進行分類，但似乎各自還有數種同工酶。組織蛋白酶A的代表性底物是N-芐氧基羰基-L-谷酰胺-L-苯丙氨酸，可能是一種羧肽酶，可為二異丙基磷氟酸（DFP）或對氯汞苯甲酸（PCMB）失活。組織蛋白酶B催化苯甲酰-L-精氨酰胺的水解。其活性的表現需要巰基化合物（SH化合物）的存在，pH在6附近，有人認為是類似木瓜蛋白酶的肽鏈內切酶，已知有B1和B2（或B′和B）二種。組織蛋白酶C的代表性底物是甘氨酰-L-苯丙酰胺，在pH5附近催化此酰胺鍵的水解，在pH7附近時催化以其它底物分子的氨基代替水分子作為受體的轉移反應，亦稱為二肽氨肽酶Ⅰ或二肽轉移酶。能為巰基化合物或Cl-離子所激活。組織蛋白酶D和E可以使用ES010(MCA-Lys-Pro-Leu-Gly-Leu-DPA-Ala-Arg-NH2)或ES001(MCA-Pro-Leu-Gly-Leu-DPA-Ala-Arg-NH2)作為底物。兩者在pH2.5—4.0顯有消化酸變性的血紅蛋白或血清白蛋白的肽鏈內切酶的作用。巰基化合物對活性沒有影響，DFP也不抑制。

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